2019-06-01, Altun, MA, Ozaydin, A, Arkan, H, Demiryas, S, Akbas, FAHRİ, Bahtiyar, N, Onaran, I, AKBAŞ, FAHRİ

2018-10-01T00:00:00Z, Yücesan, Emrah, Göncü, Beyza Servet, Başoğlu, Harun, Özten Kandaş, Nur, Kanımdan, Ebru, Akbaş, Fahri, Ersoy, Yeliz Emine, Ayşan, Mustafa Erhan, YÜCESAN, EMRAH, KANIMDAN, EBRU, AKBAŞ, FAHRİ, ERSOY, YELIZ EMINE

Amaç: Hipotiroidi tüm yaş gruplarında görülebilen, bireylerin sağlıklarının genel olarak bozulmasına neden olan klinik bir tablodur. Tedavisi genellikle yaşam boyu ilaç kullanımıdır. Bu tedaviye rağmen hormon yetmezliğine bağlı semptomlar görülmekte ve uzun dönem ilaç kullanımına bağlı yan etkiler ortaya çıkmaktadır. Hastalardaki yetersiz tiroid hormon miktarını optimum sınırlara çekmek ve hastaların yaşam kalitesini yükseltmek için tiroid dokusu transplantasyonu alternatif bir yöntem olarak önem taşımaktadır. Sunulan çalışmada, transplantasyonda immün redden etkilenmemek için hem doku kültürü hem de biyouyumlu polimerle kapsüle edilmiş tiroit dokusunun in vitro optimizasyonu amaçlanmıştır. Gereç ve Yöntemler: Mekanik yollarla kültüre edilen tiroid dokusu 2 grupta takip edilmiştir; doku kültürü ve kapsülasyon kültürü. In vitro ortamda 60 gün boyunca takip edilen kapsüllerin morfolojileri ışık mikroskopu ile birlikte T3 ve T4 hormon değerleri ise biyokimyasal olarak değerlendirilmiştir. Bulgular: 3., 9., 12., 15., 30., 45., 60. günlerde toplanan medyum örneklerinden T3 ve T4 seviyeleri gözlemlendi. Kapsüle edilen dokularda, kapsüle edilmeyenlere ve negatif kontrol dokularına göre 15. gün itibariyle T3 değerleri daha yüksek bulundu. Buna rağmen T4 seviyeleri 60 gün boyunca sabit kaldı. Sonuç: Hipotiroidinin kalıcı tedavisi için kapsüle edilen tiroid dokularının in vitro ortamda verimliliği incelenmiştir. Öncül sonuçlarımız umut vaat etmesine rağmen bu optimizasyonun in vivo hayvan çalışmalarında da doğrulandıktan sonra insan çalışmalarına geçilmesi düşünülmelidir.

2019-07-01, Kucukkaya, B, Basoglu, H, Erdag, D, Akbas, FAHRİ, Yalcintepe, L, AKBAŞ, FAHRİ, SÜSGÜN, SEDA

Intracellular calcium concentration ([Ca2+](i)) may have an important role in the development of chemoresistance, which is an essential problem in cancer chemotherapy. Cisplatin (DDP), which modulates the intracellular calcium concentration by different mechanisms, is an antineoplastic agent with high success rate in cancer therapies. We investigated the regulatory role of [Ca2+]in cisplatin resistance in epithelial ovarian cancer cell line, in MDAH-2774, and its chemoresistant subclone MDAH-2774/DDP. The measurement of [Ca2+](i) using fluorescence microscope, and flow cytometry revealed that the amount of intracellular calcium decreased in cisplatin resistant cells compared to the amounts in parental cells. mRNA expression profiles of calcium homeostasis-associated major genes (IP(3)R1/2/3, RYR1/2, SERCA1/2/3, NCX1/2/3, PMCA1/2/3, and PMCA4) decreased in cisplatin resistant cell line in comparison to the expression profiles in parental cells. Owing to the changes in the expression of genes involved in calcium regulation, these results show, drug resistance may be prevented by introducing a new perspective on the use of inhibitors and activators of these genes, and thus of cytostatic treatment strategies, due to changes in the expression of genes involved in calcium regulation.

2012-08-01T00:00:00Z, Akbas, FAHRİ, COSKUNPINAR, E, AYNACI, E, OLTULU, YM, YILDIZ, PELİN, AKBAŞ, FAHRİ, YILDIZ, PELİN

2021-10-01T00:00:00Z, Fahri, Akbas, Metin, Demirel, Ahmet, Ozaydin, Sahabettin, ŞAHBETTİN, AKBAŞ, FAHRİ, DEMİREL, METİN, SELEK, ŞAHABETTİN

Isocitrate dehydrogenase (IDH) is a fundamental enzyme for carbon metabolism in the Krebs cycle. This enzyme is required for oxidation-reduction reactions in both eukaryotic and prokaryotic cells and plays a critical role in their growth and pathogenesis. In this study, we cloned the gene encoding NAD(+) dependent isocitrate dehydrogenase from Shewanella putrefaciens. The expression of recombinant protein was induced with 0.5 mM of IPTG. His-tagged IDH overexpressed in E. coli was purified and characterized. The expressed IDH enzyme was purified in an active soluble form. The molecular weight of the enzyme was confirmed with Western blotting. High sequence homology was observed with IDH sequences of other Shewanella strains and remarkable sequence homology was found with other bacteria reported in the database.

2017-12-01, YUCESAN, Emrah, GONCU, Beyza, BAŞOĞLU, HARUN, ÖZTEN KANDAŞ, NUR, ERSOY, YELİZ EMİNE, AKBAŞ, FAHRİ, AYŞAN, MUSTAFA ERHAN, BAŞOĞLU, HARUN, GÖNCÜ, BEYZA SERVET, ÖZTEN KANDAŞ, NUR, ERSOY, YELIZ EMINE, AKBAŞ, FAHRİ, AYŞAN, MUSTAFA ERHAN

2016-10-31, BAYKARA, O, SAHIN, SK, Akbas, FAHRİ, GUVEN, M, ONARAN, I, AKBAŞ, FAHRİ

2017-09-01, GONCU, Beyza, OZDEMIR, Burcu, Basoglu, HARUN, KANDAS, Nur Ozten, Akbas, FAHRİ, TOKA, Cemile Kesgin, YUCESAN, Emrah, Kazancioglu, RÜMEYZA, AYSAN, Erhan, GÖNCÜ, BEYZA SERVET, BAŞOĞLU, HARUN, AKBAŞ, FAHRİ, KAZANCIOĞLU, RÜMEYZA

2014-10-25, POLAT, E, AKSOZ, I, ARKAN, H, COSKUNPINAR, E, Akbaş, FAHRİ, ONARAN, I, AKBAŞ, FAHRİ

2019-08-01, Meral, İsmail, Aştı, Türkinaz, Soysal, Ömer, Yıldırım, Nuran, Özçelik, Semra, Aydın, Teoman, Akbaş, Fahri, Temel, Binnur, Özder, Aclan, Büyükpınarbaşılı, Nur, Dönmez, Nazmiye, Alkaya, Mustafa Fırat, MERAL, İSMAİL, AŞTI, TÜRKINAZ, SOYSAL, ÖMER, YILDIRIM, NURAN, ÖZÇELİK, SEMRA, AYDIN, TEOMAN, AKBAŞ, FAHRİ, TEMEL, BİNNUR, ÖZDER, ACLAN, BÜYÜKPINARBAŞILI, NUR, DÖNMEZ, NAZMİYE

Girişimsel olmayan araştırmalarda, ilgili etik kurulun onayını almadan çalışmalara başlamak mümkün değildir. Dünya Sağlık Örgütü-nün kurallarına göre, gerekli tüm belgeleri içeren başvuru dosyası ilgili Etik Kurula eksiksiz sunulmalıdır. Araştırmacıların başvuru dosyasındaki belgeleri eksiksiz tamamlamadaki isteksizliği, Etik Kurulların çalışma sürecini yavaşlatmakta ve hatta Etik Kurul ile araştırmacılar arasında tartışmaya bile neden olabilmektedir. Bu nedenle bu çalışma, bir üniversitenin Girişimsel Olmayan Araştırmalar Etik Kuruluna gönderilen proje başvuru dosyalarındaki eksiklikleri ve en çok yapılan hataları göstermek ve araştırmacılar için bir rehber oluşturmak amacıyla yapıldı. 24 Mart 2016 ve 30 Haziran 2018 tarihleri arasında Girişimsel Olmayan Araştırmalar Etik Kurula gönderilen başvuru dosyaları ve kararları ilgili etik kurulun veri tabanından analiz edildi. Başvuru dosyalarının revizyonuna neden olan en önemli gerekçeler, projenin amacının ilgili referanslar eşliğinde yeterince açıklanamaması ve özellikle iyi yazılamamış yöntem kısmı gibi başvuru formundaki eksikliklerdi. Araştırmacıları proje başvuru dosyası hazırlarken en çok yapılan hatalar hakkında eğitmek, Üniversite Etik Kurullarının gözden geçirme sürecinin verimliliğini ve hızını artıracaktır.